Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl5Q5DTT4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rtl5Q5DTT4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rtl5Q5DTT4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms