Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam208bQ5DTT3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms