Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig2Q52KR2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms