Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spire1Q52KF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spire1Q52KF3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms