Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syne3Q4FZC9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms