Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms