Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms