Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4933416C03RikQ3V063 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933416C03RikQ3V063 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms