Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BB287469Q3UT53 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms