Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slc38a11Q3USY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a11Q3USY0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms