Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp560Q3URI6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms