Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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