Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrch2Q3UMG5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrch2Q3UMG5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms