Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cog7Q3UM29 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms