Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin1rt1Q3ULQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms