Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc106Q3ULM0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc106Q3ULM0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms