Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip13Q3UA06 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip13Q3UA06 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms