Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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LcorlQ3U285 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LcorlQ3U285 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LcorlQ3U285 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LcorlQ3U285 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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LcorlQ3U285 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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LcorlQ3U285 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LcorlQ3U285 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LcorlQ3U285 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms