Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Lrrn4clQ3TYX2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrn4clQ3TYX2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Lrrn4clQ3TYX2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms