Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TchpQ3TVW5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms