Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccndbp1Q3TVC7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms