Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3TTJ4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3TTJ4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms