Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms