Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trappc13Q3TIR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms