Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem248Q3TBN1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem248Q3TBN1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms