Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms