Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-3.62□□□□□ -2.99
OCA6Q12454 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-3.64□□□□□ -2.99
OCA6Q12454 snR58snR58 96 nt-3.68□□□□□ -3
OCA6Q12454 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-3.68□□□□□ -3
OCA6Q12454 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-3.73□□□□□ -3.01
OCA6Q12454 YNL338WYNL338W 159 nt-3.76□□□□□ -3.01
OCA6Q12454 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-3.78□□□□□ -3.01
OCA6Q12454 snR62snR62 100 nt-3.8□□□□□ -3.02
OCA6Q12454 snR64snR64 101 nt-3.82□□□□□ -3.02
OCA6Q12454 snR61snR61 90 nt-3.9□□□□□ -3.03
OCA6Q12454 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-3.9□□□□□ -3.03
OCA6Q12454 YNL170WYNL170W 396 nt-3.94□□□□□ -3.04
OCA6Q12454 YLR294CYLR294C 330 nt-4.01□□□□□ -3.05
OCA6Q12454 YOR225WYOR225W 330 nt-4.09□□□□□ -3.06
OCA6Q12454 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.14□□□□□ -3.07
OCA6Q12454 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.2□□□□□ -3.08
OCA6Q12454 Q0032Q0032 291 nt-4.26□□□□□ -3.09
OCA6Q12454 snR40snR40 97 nt-4.35□□□□□ -3.11
OCA6Q12454 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-4.45□□□□□ -3.12
OCA6Q12454 snR53snR53 91 nt-4.48□□□□□ -3.13
OCA6Q12454 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-4.7□□□□□ -3.16
OCA6Q12454 YHR217CYHR217C 462 nt-4.89□□□□□ -3.19
OCA6Q12454 YMR326CYMR326C 309 nt-4.92□□□□□ -3.2
OCA6Q12454 Q0143Q0143 153 nt-5.13□□□□□ -3.23
OCA6Q12454 ATP8Q0080 147 nt-5.16□□□□□ -3.24
OCA6Q12454 YBL109WYBL109W 336 nt-5.46□□□□□ -3.28
OCA6Q12454 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-5.71□□□□□ -3.32
OCA6Q12454 Q0092Q0092 141 nt-5.91□□□□□ -3.36
OCA6Q12454 snR75snR75 89 nt-6.04□□□□□ -3.38
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 3.6 ms