Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 YBL109WYBL109W 336 nt-0.91□□□□□ -2.56
TIR4Q12218 snR64snR64 101 nt-0.95□□□□□ -2.56
TIR4Q12218 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.98□□□□□ -2.57
TIR4Q12218 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.02□□□□□ -2.57
TIR4Q12218 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.02□□□□□ -2.57
TIR4Q12218 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.03□□□□□ -2.57
TIR4Q12218 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.04□□□□□ -2.58
TIR4Q12218 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.05□□□□□ -2.58
TIR4Q12218 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-1.1□□□□□ -2.59
TIR4Q12218 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.1□□□□□ -2.59
TIR4Q12218 snR53snR53 91 nt-1.21□□□□□ -2.6
TIR4Q12218 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.24□□□□□ -2.61
TIR4Q12218 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.28□□□□□ -2.61
TIR4Q12218 snR6snR6 112 nt-1.29□□□□□ -2.62
TIR4Q12218 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.33□□□□□ -2.62
TIR4Q12218 YOR309CYOR309C 381 nt-1.34□□□□□ -2.62
TIR4Q12218 snR73snR73 106 nt-1.43□□□□□ -2.64
TIR4Q12218 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-1.43□□□□□ -2.64
TIR4Q12218 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-1.61□□□□□ -2.67
TIR4Q12218 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.66□□□□□ -2.68
TIR4Q12218 snR40snR40 97 nt-1.8□□□□□ -2.7
TIR4Q12218 snR58snR58 96 nt-1.9□□□□□ -2.71
TIR4Q12218 YDR543CYDR543C 300 nt-2.06□□□□□ -2.74
TIR4Q12218 snR87snR87 109 nt-2.07□□□□□ -2.74
TIR4Q12218 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.11□□□□□ -2.75
TIR4Q12218 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.13□□□□□ -2.75
TIR4Q12218 snR75snR75 89 nt-2.18□□□□□ -2.76
TIR4Q12218 YJR162CYJR162C 351 nt-2.9□□□□□ -2.87
TIR4Q12218 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.31□□□□□ -2.94
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 2.2 ms