Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
TY3A-G	Q12173	snR6	snR6	112 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
TY3A-G	Q12173	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
TY3A-G	Q12173	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
TY3A-G	Q12173	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
TY3A-G	Q12173	snR64	snR64	101 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
TY3A-G	Q12173	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
TY3A-G	Q12173	YHR217C	YHR217C	462 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
TY3A-G	Q12173	YMR326C	YMR326C	309 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
TY3A-G	Q12173	snR73	snR73	106 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
TY3A-G	Q12173	YBL109W	YBL109W	336 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
TY3A-G	Q12173	YLL066W-B	YLL066W-B	171 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
TY3A-G	Q12173	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
TY3A-G	Q12173	snR85	snR85	171 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
TY3A-G	Q12173	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
TY3A-G	Q12173	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
TY3A-G	Q12173	snR53	snR53	91 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
TY3A-G	Q12173	YLR149C-A	YLR149C-A	87 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
TY3A-G	Q12173	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
TY3A-G	Q12173	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
TY3A-G	Q12173	YDR543C	YDR543C	300 nt		-1.84	□□□□□ -2.7
TY3A-G	Q12173	YDL247W-A	YDL247W-A	75 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
TY3A-G	Q12173	snR87	snR87	109 nt		-2.04	□□□□□ -2.74
TY3A-G	Q12173	snR40	snR40	97 nt		-2.06	□□□□□ -2.74
TY3A-G	Q12173	snR58	snR58	96 nt		-2.18	□□□□□ -2.76
TY3A-G	Q12173	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-2.37	□□□□□ -2.79
TY3A-G	Q12173	YJR162C	YJR162C	351 nt		-2.68	□□□□□ -2.84
TY3A-G	Q12173	snR75	snR75	89 nt		-2.69	□□□□□ -2.84
TY3A-G	Q12173	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-3.24	□□□□□ -2.93

Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.3 ms