Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-3.06□□□□□ -2.9
ATG41Q12048 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-3.07□□□□□ -2.9
ATG41Q12048 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-3.09□□□□□ -2.9
ATG41Q12048 snR61snR61 90 nt-3.13□□□□□ -2.91
ATG41Q12048 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-3.13□□□□□ -2.91
ATG41Q12048 snR62snR62 100 nt-3.15□□□□□ -2.91
ATG41Q12048 snR64snR64 101 nt-3.26□□□□□ -2.93
ATG41Q12048 YNL170WYNL170W 396 nt-3.26□□□□□ -2.93
ATG41Q12048 Q0032Q0032 291 nt-3.28□□□□□ -2.93
ATG41Q12048 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.31□□□□□ -2.94
ATG41Q12048 snR87snR87 109 nt-3.37□□□□□ -2.95
ATG41Q12048 YLR294CYLR294C 330 nt-3.51□□□□□ -2.97
ATG41Q12048 snR58snR58 96 nt-3.52□□□□□ -2.97
ATG41Q12048 YOR225WYOR225W 330 nt-3.6□□□□□ -2.99
ATG41Q12048 snR53snR53 91 nt-3.86□□□□□ -3.03
ATG41Q12048 YJR162CYJR162C 351 nt-3.91□□□□□ -3.04
ATG41Q12048 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-3.91□□□□□ -3.04
ATG41Q12048 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-3.93□□□□□ -3.04
ATG41Q12048 snR40snR40 97 nt-3.98□□□□□ -3.05
ATG41Q12048 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4□□□□□ -3.05
ATG41Q12048 YMR326CYMR326C 309 nt-4□□□□□ -3.05
ATG41Q12048 YHR217CYHR217C 462 nt-4.01□□□□□ -3.05
ATG41Q12048 ATP8Q0080 147 nt-4.04□□□□□ -3.06
ATG41Q12048 Q0143Q0143 153 nt-4.14□□□□□ -3.07
ATG41Q12048 YBL109WYBL109W 336 nt-4.51□□□□□ -3.13
ATG41Q12048 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.61□□□□□ -3.15
ATG41Q12048 Q0092Q0092 141 nt-4.64□□□□□ -3.15
ATG41Q12048 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-4.74□□□□□ -3.17
ATG41Q12048 snR75snR75 89 nt-5.36□□□□□ -3.27
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms