Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cib3Q0P523 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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