Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms