Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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F13bQ07968 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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F13bQ07968 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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F13bQ07968 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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F13bQ07968 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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F13bQ07968 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
F13bQ07968 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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