Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col17a1Q07563 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col17a1Q07563 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col17a1Q07563 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms