Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cntn3Q07409 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms