Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms