Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39Q06138 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms