Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPINDOCQ05AH6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPINDOCQ05AH6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms