Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Caprin2Q05A80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms