Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apoc2Q05020 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apoc2Q05020 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms