Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk18Q04899 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms