Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sox13Q04891 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sox13Q04891 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms