Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thbs2Q03350 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms