Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mark3Q03141 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mark3Q03141 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms