Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkczQ02956 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms