Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Muc1Q02496 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Muc1Q02496 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms