Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VcpQ01853 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VcpQ01853 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VcpQ01853 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms