Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme2Q01768 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms