Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2cQ01098 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin2cQ01098 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms