Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SeleQ00690 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SeleQ00690 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SeleQ00690 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SeleQ00690 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SeleQ00690 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SeleQ00690 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms